158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3308 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  35.55 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  33.21 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  33.21 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.48 
 
 		 258 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.19 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.14 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.32 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.14 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  33.58 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  30.91 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  28.62 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  32.95 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  34 
 
 		 317 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  33.82 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.11 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  31.39 
 
 		 285 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  41.32 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  40 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  30.2 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  35.25 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.6 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  38.95 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  33.72 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  33.33 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  40.22 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  34.45 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  30 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  33.33 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  34.39 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  33.33 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  44.57 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  42.11 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  43.48 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  35.71 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  30.08 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  36.8 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  40 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  40.59 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  36.8 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  40.22 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  30.86 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  30.47 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  35.71 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  21.34 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  25 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  34.13 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  36 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  34.58 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  39.76 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  29.66 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  43.96 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  34 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  40.22 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  35.24 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  34.41 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.14 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  38.04 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.14 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  31.55 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  33.33 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  33.7 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  35.94 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  33.6 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  33.6 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  27.72 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  42.22 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  36.54 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  25.76 
 
 		 431 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  36.6 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  30.34 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  27.51 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  31.48 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  37.36 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  33.73 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  26.49 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.34 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  32.26 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  35.8 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  39.66 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  35.35 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  34.65 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  41.43 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  31.52 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  38.55 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  34.15 
 
 		 265 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  32.93 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  40 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  44.23 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  30 
 
 		 294 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  35.71 
 
 		 475 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40.26 
 
 		 117 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  29.09 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  38.64 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  23.11 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  30.84 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  30.77 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  32.93 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  38.24 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  40 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>