105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1624 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  100 
 
 
285 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  45.61 
 
 
489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  74.29 
 
 
926 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  42.86 
 
 
484 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  60.33 
 
 
630 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  68.03 
 
 
423 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  63.92 
 
 
444 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  60 
 
 
1261 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  38.68 
 
 
928 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  29.49 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  52.5 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  38.21 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.75 
 
 
1888 aa  67  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  57.69 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50.52 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.44 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  22.46 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  25.13 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  34.65 
 
 
897 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  30.3 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  34.15 
 
 
5185 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  29.93 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.33 
 
 
830 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  21.88 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.01 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.01 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  23.73 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  41.76 
 
 
407 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4086  putative granule-associated protein  50.72 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00010965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.22 
 
 
2313 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.75 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  30.77 
 
 
1197 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  25.29 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  32.51 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  40.68 
 
 
1281 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  30.34 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  39.13 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  39.62 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  37.25 
 
 
223 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1296  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  43.33 
 
 
550 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354374  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  29.79 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  35.14 
 
 
480 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.17 
 
 
586 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.69 
 
 
1162 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  37.76 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  37.76 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.76 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 
590 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  31.34 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  50.44 
 
 
537 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4840  hypothetical protein  29.69 
 
 
908 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191443  hitchhiker  0.00180703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  30.3 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  37.08 
 
 
776 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  24.16 
 
 
778 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  60.71 
 
 
3409 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  23.91 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  26.81 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  37.04 
 
 
368 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  29.03 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  33.56 
 
 
453 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  32.47 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.46 
 
 
602 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  27.61 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0525  hypothetical protein  47.62 
 
 
334 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  54.95 
 
 
598 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  28.71 
 
 
245 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0454  hypothetical protein  32.17 
 
 
744 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  33.67 
 
 
499 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  27.73 
 
 
1567 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6484  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.47 
 
 
1257 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  26.75 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  32.52 
 
 
746 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  30.38 
 
 
248 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  28.85 
 
 
1225 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  27.83 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  45.3 
 
 
2353 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  32.05 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  31.29 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.4 
 
 
671 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  33.7 
 
 
433 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  36.73 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  32.23 
 
 
625 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  30.77 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  27.78 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  59.52 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  26.32 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  30.4 
 
 
572 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  31 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  25.51 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  51.43 
 
 
1409 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.54 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  39.58 
 
 
882 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1911  hypothetical protein  22.4 
 
 
1934 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.225892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  28.95 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  29.59 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  23.3 
 
 
279 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  27.14 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01890  hypothetical protein  42.62 
 
 
654 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.027163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>