197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4086 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  100 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.71 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  29.24 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.63 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  28.43 
 
 
268 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.65 
 
 
268 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  36.36 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.45 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  28.09 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.64 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  30.73 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  35.16 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.14 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  33.33 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  28 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  28 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  38.71 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  35.79 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  35.42 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  33.1 
 
 
250 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  37.86 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  48.48 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  36.46 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  30.91 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  30.77 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  31.87 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  25.43 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  31.87 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  36 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.29 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  28.82 
 
 
217 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  29.3 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  25.84 
 
 
264 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.65 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.84 
 
 
280 aa  59.3  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  29.15 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  29.09 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  33.33 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  31.14 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  38.96 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  38.96 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  38.96 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.59 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  25.41 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  27.91 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  28.48 
 
 
227 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  27.6 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  37.18 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  37.18 
 
 
229 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  37.18 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
248 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.03 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  35.9 
 
 
243 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  38.96 
 
 
244 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  37.5 
 
 
280 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  22.95 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  35.9 
 
 
226 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  35.9 
 
 
226 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  35.87 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  35.9 
 
 
243 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  35.9 
 
 
243 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.58 
 
 
324 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  34.29 
 
 
251 aa  55.8  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  27.56 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  31.87 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  25.89 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  37.84 
 
 
484 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  37.18 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.81 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  29.28 
 
 
451 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  31.46 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  34.62 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.81 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.94 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  37.59 
 
 
489 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  34.62 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  25.64 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  35.9 
 
 
441 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  25.85 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  25.14 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  22.87 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  22.74 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  36.62 
 
 
164 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  31.87 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  36.62 
 
 
202 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  33 
 
 
263 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  29.67 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  50 
 
 
224 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  29.27 
 
 
241 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  27.59 
 
 
258 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  29.62 
 
 
283 aa  52.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  29.03 
 
 
272 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  30.3 
 
 
233 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  27.33 
 
 
235 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  22.07 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  28.7 
 
 
171 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>