45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0613 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  100 
 
 		 495 aa  926    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  39.47 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2854  TonB family protein  31.42 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  42.05 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  41.49 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.28 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  42.39 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  36.84 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  36.84 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  37.78 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  39.22 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  36.84 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  39.08 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  33.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  42.17 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  40.22 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  37.04 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.26 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  42.7 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  32 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  47.83 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  38.2 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  38.89 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  43.61 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  36.14 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  38.89 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  41.98 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  43.94 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  35.16 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  38.46 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  34.04 
 
 		 248 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  42.86 
 
 		 277 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  29.63 
 
 		 263 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  36.36 
 
 		 289 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  42.35 
 
 		 282 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  32.98 
 
 		 324 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.96 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  46.67 
 
 		 263 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  34.83 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  45.45 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  34.25 
 
 		 244 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  35.71 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  32.43 
 
 		 280 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  35.37 
 
 		 237 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>