133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0507 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  100 
 
 
272 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  35.71 
 
 
296 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  35.51 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.41 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  31.05 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  30.71 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  47.95 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  24.13 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.87 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  33.33 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  37.93 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  42.03 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  38.1 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  41.77 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  40.43 
 
 
495 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.17 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  42.7 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  23.86 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  23.86 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  23.86 
 
 
267 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.7 
 
 
336 aa  58.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  43.66 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  38.03 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  42.7 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  42.7 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  32.26 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  42.11 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  40.22 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  38.46 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  38.46 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  46.43 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  28.42 
 
 
248 aa  55.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  30.12 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  45.31 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.37 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  33.55 
 
 
451 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  27.42 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  36.62 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  32 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  38.81 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  38.81 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  39.73 
 
 
208 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  40.79 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.45 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  26.32 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  39.73 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  36.36 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  29.61 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  33.93 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.04 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  31.87 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  31.87 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  33.51 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  38.36 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  39.13 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  30.46 
 
 
354 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  38.36 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  38.36 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  43.84 
 
 
266 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  27.78 
 
 
300 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  40.23 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  35.44 
 
 
239 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  34.07 
 
 
411 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  42.19 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  42.19 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  45.45 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  41.27 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  37.93 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  43.64 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  30.7 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  43.64 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.33 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  37.84 
 
 
235 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  43.64 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  43.64 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  31.82 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  36.49 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44.9 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  50 
 
 
88 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  43.64 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30.43 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  29.79 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  38.75 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  43.64 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  35.29 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  43.64 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  43.64 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  45.45 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  30.21 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  42.31 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  27.81 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2854  TonB family protein  39.36 
 
 
341 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145381  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  43.64 
 
 
245 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.46 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  26.49 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  28.67 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  35.71 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  35.06 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  35.06 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  41.07 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0825202 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>