158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2420 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  100 
 
 		 285 aa  550  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  65.96 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  51.63 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  51.5 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  52.35 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  55.94 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.5 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  37.72 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  34.97 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  34.97 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  35.11 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  37.39 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.12 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.12 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  31.14 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  49.46 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.64 
 
 		 258 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  32.45 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  48.42 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  29.64 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  43.62 
 
 		 251 aa  89  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  46.74 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  34.31 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  45.74 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  44.68 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  34.17 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  34.13 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  27.82 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  35.76 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  42.86 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  30.11 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  48.31 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  27.68 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.64 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  29.19 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  38.02 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  29.86 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  44.94 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  40.45 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  38.65 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  41.84 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  29.39 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  29.39 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  39.36 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  39.36 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  39.36 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  32.46 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  42.39 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  40.22 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  24.31 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  32.09 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  35.79 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  23.89 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  38.3 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  37.38 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  33.17 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  37.23 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  39.13 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  30.63 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  40 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  35.66 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  37.63 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  24.7 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  35.24 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  35.48 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  35.48 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  28.43 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  30.49 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  36.89 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  23.66 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  29.8 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  43.01 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  43.59 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  40.28 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  27.63 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  32.35 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  39.13 
 
 		 88 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.42 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.42 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  39.13 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  31.58 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  28.65 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  39.13 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  39.13 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  24.4 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  37.5 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  28.97 
 
 		 443 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  36.96 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  36.96 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.72 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.71 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  38.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  25.85 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  37.5 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  36.08 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  36.73 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  37.5 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  29.21 
 
 		 386 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>