54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3015 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  100 
 
 
443 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  52.51 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.34 
 
 
292 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  29.93 
 
 
330 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  29.91 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  41.33 
 
 
315 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  29.8 
 
 
292 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.11 
 
 
324 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.82 
 
 
336 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  33.33 
 
 
248 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  36.23 
 
 
220 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  34.38 
 
 
279 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  32.46 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32 
 
 
248 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  32.1 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  32.1 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  40.22 
 
 
245 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  29.73 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.85 
 
 
292 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.79 
 
 
256 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  32.1 
 
 
243 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  34.21 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  23.38 
 
 
288 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  32.56 
 
 
201 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  36.25 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  32.43 
 
 
248 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  32.22 
 
 
269 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  33.78 
 
 
341 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  33.33 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.33 
 
 
250 aa  46.2  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  30.86 
 
 
244 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  34.44 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  34.04 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  38.67 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  29.41 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  30 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  37.04 
 
 
237 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  29.22 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  32.14 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  30 
 
 
264 aa  45.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  29.22 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.12 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  36 
 
 
225 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  27.52 
 
 
294 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  35.8 
 
 
280 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  30 
 
 
286 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  37.33 
 
 
301 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  32.94 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  38.67 
 
 
297 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  38.67 
 
 
319 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  30.77 
 
 
304 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  28.89 
 
 
290 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  29.22 
 
 
300 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  27.81 
 
 
239 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>