43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0730 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  100 
 
 		 225 aa  443  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  47.93 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  39 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  41.94 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  32.2 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  33.7 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  35.48 
 
 		 292 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  27.17 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  39.36 
 
 		 285 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  25.34 
 
 		 288 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  28.57 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  28.57 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  31.76 
 
 		 310 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  29.7 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.43 
 
 		 308 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  25.51 
 
 		 277 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  35.71 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  28.42 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  36.36 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  38.81 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  33.73 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  34.18 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  35.8 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.05 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  33.33 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  27.5 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.97 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.62 
 
 		 2449 aa  42.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  28.49 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4555  TonB-like protein  27.88 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248985  normal  0.0574394 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  25.21 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.57 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  28.32 
 
 		 304 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  28.57 
 
 		 300 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  39.68 
 
 		 164 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  34.57 
 
 		 294 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  39.68 
 
 		 202 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  24.44 
 
 		 330 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  34.15 
 
 		 300 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  25.79 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  34.15 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.52 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.52 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>