108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1015 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  99.66 
 
 
291 aa  584  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  73.33 
 
 
291 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  66.55 
 
 
294 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  41.1 
 
 
292 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  37.55 
 
 
297 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  38.82 
 
 
300 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  36.82 
 
 
319 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  38.06 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  38.06 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  38.08 
 
 
297 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  36.55 
 
 
300 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  37.28 
 
 
301 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.33 
 
 
298 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  33.57 
 
 
288 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  33.77 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  39.92 
 
 
294 aa  148  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  34.35 
 
 
288 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  33.45 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  36.71 
 
 
299 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  36.92 
 
 
307 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  32.07 
 
 
286 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  35.56 
 
 
295 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  31.58 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  32.69 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  37.14 
 
 
333 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  31.44 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  35.38 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  43.57 
 
 
300 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  32.58 
 
 
304 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  31.82 
 
 
304 aa  99  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  31.82 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  30.55 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  29.48 
 
 
323 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  32.27 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  30.45 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  30.6 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  29.89 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  26.2 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  34.17 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  28.73 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  27.6 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  27.37 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  28.08 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  27.05 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  27.35 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  38.73 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  28.02 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  30.3 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  35.04 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.32 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  35.79 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.79 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  40.58 
 
 
654 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  25.58 
 
 
264 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  37.25 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  26.1 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  28.78 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  39.74 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  34.67 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  34.67 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  44.83 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  38.54 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  35.44 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.29 
 
 
248 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  34.57 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  37.5 
 
 
252 aa  48.9  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  26.72 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  40 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  34.21 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  39.44 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  37.93 
 
 
265 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  35.63 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  24.73 
 
 
297 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  36.67 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  46.3 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  52.08 
 
 
315 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  37.66 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  42.37 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  38.33 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  21.4 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.47 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  34.78 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  33.71 
 
 
225 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  38.98 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  37.66 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  42.62 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  40.91 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  39.47 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  41.38 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4555  TonB-like protein  43.14 
 
 
369 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248985  normal  0.0574394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.25 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  37.84 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.25 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  34.25 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  37.14 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  28.97 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  26.23 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  32.39 
 
 
230 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  35.56 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>