149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  40.71 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  43.57 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  57.58 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  58.42 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  58.42 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  58.42 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  55.67 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  31.32 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  26.32 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.85 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  31.83 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.94 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  46.39 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  32.19 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  27.64 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  27.64 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.74 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  27.64 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.2 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  26.01 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  31.88 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  30.58 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  27.57 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  39.45 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.21 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  33.56 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  27.96 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  41.05 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  30.53 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  33.33 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  42.55 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  44.87 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  30.37 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  30.37 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  46.74 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  32.91 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  29.03 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  34.31 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  38.04 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  30.05 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  33.52 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  37.5 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  43.16 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  42.47 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  29.46 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  34.15 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  29.75 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.26 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.16 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  38.3 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 308 aa  62  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  35.34 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  35.34 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  34.78 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  30 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  30.69 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  25.13 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  32.04 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.44 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  22.26 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  33.77 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  25.27 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  24.73 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.85 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  30.77 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.25 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  32.95 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  39.29 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  36 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  30.06 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  26.9 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  25.31 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  34.07 
 
 		 114 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  29.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  28.17 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  36.71 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  24.4 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  33.66 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  23.61 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  36.96 
 
 		 88 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  32.98 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  43.14 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  25.82 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  44 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  32.41 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  35.21 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  48 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  27.86 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30.97 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  44 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  28.42 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  26.45 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  26.95 
 
 		 1888 aa  47  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  26.9 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.37 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  31.11 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  38.33 
 
 		 164 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  39.02 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>