97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1133 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  100 
 
 		 270 aa  524  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  52.61 
 
 		 264 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  50.4 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  55.24 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  50.2 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  53.63 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  53.63 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  36.96 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  35.08 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.21 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  31.37 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  32.58 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  32.58 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  47.31 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  31 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  28.79 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.55 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  43.01 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.55 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  29.55 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  44.83 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  31.43 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  44.83 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  32.12 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  45.56 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  26.35 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  39.13 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  45.56 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  45.56 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30.74 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  45.56 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  37.5 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  31.97 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  42.2 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  44.44 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.56 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  42.05 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  39.33 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  37.04 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  37.61 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  38.3 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  38.3 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  42.86 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  42.86 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  42.86 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  40.66 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  38.2 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  32 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  39.33 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  28.74 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  22.09 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  39.77 
 
 		 88 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  36.26 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  37.78 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  28.82 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  30 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  36 
 
 		 495 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  37.08 
 
 		 171 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  37.5 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  34.44 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  38.18 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.7 
 
 		 411 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  31.63 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  32.98 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  29.23 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4651  TonB family protein  45.59 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  35.62 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  32.56 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  32.56 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  45.59 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.03 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  30.28 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.46 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  49.02 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.65 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  31.82 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  39.13 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  31.58 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0601  TonB family protein  40.3 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  36.23 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  27.5 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  39.13 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  39.13 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  39.13 
 
 		 163 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  36.11 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0875  TonB, C-terminal  32.43 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  40.62 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  28.42 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  30.77 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  30.77 
 
 		 366 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  31.82 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1013  tonB domain protein  32.43 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  42 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  40.3 
 
 		 386 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  26.88 
 
 		 235 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>