51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0922 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  100 
 
 		 294 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  98.98 
 
 		 294 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  80.68 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  34.29 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  34.68 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0567  TonB family protein  44.68 
 
 		 182 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.584619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  43.9 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  44.68 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  44.68 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  34.03 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  26.02 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.78 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  42.55 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  30.7 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  39.51 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.78 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  37.8 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  28.81 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0855  TonB family protein  44.58 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.06 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  29.35 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  37.5 
 
 		 88 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  27.97 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  27.97 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  30.98 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  27.39 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  32.95 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.09 
 
 		 2272 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  37.04 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  33.33 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  27.27 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.62 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  35.34 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  29.73 
 
 		 2179 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  28.23 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2079  TonB family protein  35.48 
 
 		 126 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  27.7 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  30 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  28.07 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  28.07 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  37.31 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  34.18 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  30.38 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  30.52 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30.56 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  26.97 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1397  TonB family protein  37.35 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  30.65 
 
 		 431 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  28.8 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>