36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0725 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  100 
 
 		 282 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  32.51 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  30.63 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  29.55 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  29.55 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  36.72 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.96 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  25.9 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30.34 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  28.81 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.57 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  27.87 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.54 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  29.17 
 
 		 451 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  36.78 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  21.31 
 
 		 2449 aa  48.9  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  31.71 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  27.98 
 
 		 315 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  33.81 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  29.46 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.23 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  26.6 
 
 		 264 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  33.33 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  29.46 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.45 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.39 
 
 		 3409 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  30.7 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  33.33 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  27.78 
 
 		 3472 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  27.78 
 
 		 3471 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  29.66 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 3521 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  23.99 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  23.99 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  23.99 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>