88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1256 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  100 
 
 
325 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  66.06 
 
 
308 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  60.92 
 
 
283 aa  291  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.49 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  29.84 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  33.08 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  26.61 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  25.65 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  29.74 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  26.89 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  30.94 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  37.63 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  32.21 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  32.73 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  29.41 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  29.3 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  31.54 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  29.37 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  28.64 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  32.95 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  26.17 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  30.67 
 
 
239 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  36.36 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  33.53 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  32.41 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  32.41 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  32.41 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3167  protein TolA  29.61 
 
 
331 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0922  putative TonB protein  35.35 
 
 
294 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.702209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  35.45 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  35.45 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  37.33 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2581  TonB family protein  35.23 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.632604  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  29.55 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  27.78 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  31.18 
 
 
258 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.84 
 
 
2449 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  39.44 
 
 
219 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  37.68 
 
 
88 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.88 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  31.01 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2994  TonB family protein  35.14 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.7532  normal  0.152882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  29.27 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  45.16 
 
 
261 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  29.89 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  30.28 
 
 
279 aa  53.1  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  34.21 
 
 
237 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  29.94 
 
 
354 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  43.14 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0725  TonB family protein  32.88 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398336  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  26.01 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  27.66 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  29.57 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  28.89 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  29.57 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  37.31 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  31.46 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  25.93 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  25.73 
 
 
248 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  36.92 
 
 
330 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  35.82 
 
 
163 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  43.14 
 
 
495 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  35.82 
 
 
163 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.74 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  29.7 
 
 
244 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  44.07 
 
 
419 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  42.37 
 
 
431 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  44.07 
 
 
419 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  31.76 
 
 
443 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  29.33 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.72 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  34.38 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  28.71 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  28.71 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  44.9 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  29.17 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  37.7 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  37.5 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  35.29 
 
 
167 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  26.57 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  32.61 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  36.54 
 
 
180 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  35.29 
 
 
142 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.99 
 
 
264 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  47.27 
 
 
489 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  42 
 
 
245 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  46.32 
 
 
444 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  37.5 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>