118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5557 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  100 
 
 		 248 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  57.49 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  63.31 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  59.92 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  57.09 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  57.09 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  62.1 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  57.69 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.14 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  40 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  37.55 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  30.52 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  32.28 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  33.2 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  30.04 
 
 		 258 aa  88.6  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  32.97 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  40.68 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.97 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  31.58 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  30.86 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  30.86 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  45.35 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  33.77 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  48.68 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  46.05 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  30.91 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  39.45 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  31.03 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  40.86 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  40.22 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  38.71 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.2 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  31.12 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  33.61 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  38.02 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  32.96 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  39.58 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  33.77 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  39.56 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  35.56 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  37.63 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  37.37 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  39.56 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  32.28 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  39.56 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  30.07 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  31.33 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  27.59 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.4 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  29.19 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  36.26 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.02 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  33.64 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  33.64 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  33.64 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  35.05 
 
 		 114 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  35.05 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1256  TonB family protein  38.2 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  38.36 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.9 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  32.48 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.72 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  43.33 
 
 		 164 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  26.37 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  28.24 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  32.94 
 
 		 495 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  30.53 
 
 		 171 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  43.33 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  37.65 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  30.5 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.18 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  30.5 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  27.7 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  31.51 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  30.53 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.35 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  25.44 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  30 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  33.71 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  27 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  33.53 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  38.96 
 
 		 88 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  28.15 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.85 
 
 		 1888 aa  47  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  26.67 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  36.71 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  26.67 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  36.71 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  32.35 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.05 
 
 		 2449 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  26.52 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  24.19 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  25.68 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  41.18 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  41.18 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82620  predicted protein  36.84 
 
 		 892 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338646  normal  0.971769 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  41.18 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>