76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0588 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  98.14 
 
 		 323 aa  653    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  100 
 
 		 323 aa  664    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  33.21 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  34.07 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  34.07 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  31.73 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  31.73 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  30.37 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  31.84 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  32.6 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  32.6 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  32.6 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  33.04 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  31.91 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.48 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  28.26 
 
 		 292 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  30.55 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  30.55 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  29.2 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  28.32 
 
 		 288 aa  92.4  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  32.13 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  36.84 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  29.37 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  35.88 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  27.86 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  34.31 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  30.16 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  24.32 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  26.96 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  25.97 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  23.97 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  25 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  25.62 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  25.68 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  26.05 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  25.71 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  26.92 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  28.17 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  37.93 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  25.56 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  26.42 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  26.04 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  26.42 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  26.14 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  28.68 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  23.93 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  33.01 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  29.81 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  27.94 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  30.7 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  30.7 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.98 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  36.28 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  38.98 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.51 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  29.73 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  43.08 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.78 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  26.67 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  36.51 
 
 		 174 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  36.51 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  32.35 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  33.33 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  33 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  25 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  32.93 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.77 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  35.82 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.26 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  37.93 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  28.57 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  30.85 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  38.89 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  28.57 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  31.18 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>