104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5125 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  100 
 
 
263 aa  482  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33.93 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  44.21 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  34.04 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  39.13 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.11 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  42.55 
 
 
292 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  41.94 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  38.18 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  25.09 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  39.78 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  32.26 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  32.26 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  32.26 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  43.01 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  39.78 
 
 
154 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  35.87 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  40.43 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  43.3 
 
 
291 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  37.89 
 
 
280 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.33 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  35.23 
 
 
248 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  38.71 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  42.39 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  41.1 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  36.46 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  33.68 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  39.13 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  36.46 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.87 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  30.84 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  38.95 
 
 
292 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  38.78 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  34.02 
 
 
295 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  32.88 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  37.37 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  46.67 
 
 
495 aa  53.5  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  35.06 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  41.76 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  25.97 
 
 
336 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  40.85 
 
 
292 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  36.17 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  27.78 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  34.67 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  35.79 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  38.64 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  38.64 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  30.86 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  29.88 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  39.02 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  36.96 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  29.88 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  44.58 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  38.78 
 
 
507 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  33.98 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  36.26 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  34.41 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  36.62 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  38.89 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  33.33 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  38.89 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  38.89 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  32.26 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  34.41 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  41.03 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  34.41 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  34.41 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  34.04 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  38.55 
 
 
252 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  32.04 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.71 
 
 
243 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  39.02 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  36.71 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  31.07 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0720  TonB, C-terminal  39.77 
 
 
216 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.274821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.96 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.96 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  31.07 
 
 
300 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  36.71 
 
 
218 aa  45.4  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  31.07 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  32.04 
 
 
319 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  32.04 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  31.58 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  44.83 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  29.67 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  30.06 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  36.9 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  37.5 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  30.59 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  41.67 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  44.83 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  27.55 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  39.47 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  30.19 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  32.04 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  34.78 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  30.1 
 
 
301 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  30.1 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  36.71 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  30.1 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>