81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0470 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  94.02 
 
 
301 aa  554  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  93.02 
 
 
301 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  93.02 
 
 
301 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  74.24 
 
 
300 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  73.56 
 
 
297 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  76.74 
 
 
299 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  72.28 
 
 
298 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  68.66 
 
 
297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  67.72 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  70.28 
 
 
297 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  44.91 
 
 
288 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  41.38 
 
 
286 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  41.05 
 
 
292 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  39.86 
 
 
294 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  36.55 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  36.55 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  35.66 
 
 
294 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  36.21 
 
 
288 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  34.85 
 
 
316 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  33.21 
 
 
323 aa  149  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  33.58 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  36.79 
 
 
291 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  36.43 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  37.55 
 
 
300 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  34.7 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  36.99 
 
 
310 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  38.55 
 
 
294 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  33.1 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  40.7 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  33.22 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  32.39 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  31.47 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  31.25 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  31.25 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  31.78 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  27.08 
 
 
282 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  27.85 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  38 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  28.57 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  25.74 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  24.58 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  33.83 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  30.27 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  30.27 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  25.83 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  26.74 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  26.92 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  26.32 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  26.57 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  36.36 
 
 
654 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  31.16 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  45.61 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  31.61 
 
 
239 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  40 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  34.38 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.52 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  34.38 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.52 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  27.57 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  25.11 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  37.14 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  22.83 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  41.07 
 
 
261 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  35.62 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  31.25 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  36.23 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  39.34 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  25.95 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  27.81 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  31.88 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  23.86 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  31.07 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.11 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  38.89 
 
 
164 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  38.89 
 
 
202 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  33.33 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  38.18 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.84 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  39.29 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  27.13 
 
 
250 aa  42.4  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>