90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1368 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  100 
 
 		 277 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  45.03 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  30.11 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  38.71 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  32.04 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  33.33 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  33.33 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  27.86 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.19 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  30.77 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  29.67 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  25.09 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  25.13 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  38.96 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  23.78 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  28.5 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  24.91 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  25.53 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  23.48 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  34.07 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  25.53 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  30.34 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  26.59 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  27.1 
 
 		 319 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  25.87 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  33.77 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  27.84 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  29.79 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  25.95 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  31.65 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.17 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  31.65 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  25.22 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  28.14 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  28.37 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  25.86 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  44.44 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  25.86 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  24.63 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  23.64 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  36.47 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  28.41 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  40.68 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  25.75 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  41.07 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  31.46 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  37.14 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  22.58 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  30 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  24.82 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  32.47 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  25.25 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  24.18 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  33.77 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  32.47 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  36.36 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  28.87 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  24.35 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  26.04 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.58 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  26.04 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  35.62 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  28.57 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  32.47 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  31.58 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  21.43 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  31.58 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  29.49 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  29.85 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  29.36 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  27.3 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  30.38 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  28.64 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  39.29 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  27.37 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.78 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  25.71 
 
 		 484 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  31.31 
 
 		 485 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  25.52 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.58 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  24.51 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  36.36 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0853  TonB-like  36 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1560  TonB family protein  35.19 
 
 		 537 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  28 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  32.5 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  24.57 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.32 
 
 		 264 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>