91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0937 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  100 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  44.69 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  37.93 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  37.24 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  36.46 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  37.24 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  36.33 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  35.27 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  36.36 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  36.5 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.06 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  41.29 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  34.35 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  34.35 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  35.27 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  35.64 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  35.86 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  36.24 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  35.86 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  37.2 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  31.13 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.16 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  31.45 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  33.33 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  32.74 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  35.04 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  49.23 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  34.87 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  29.68 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  31.13 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  26.98 
 
 		 323 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  27.7 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  30 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  28.93 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  26.67 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  27.61 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  26.8 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  26.47 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  25 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  25 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  25.96 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  29.24 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  24.35 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  24.82 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.09 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  27.18 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  27.18 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  25.95 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  27.92 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  24.28 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  39.24 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  26.62 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  41.27 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  27.2 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  36.25 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  37.97 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  41.67 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  40 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  30.53 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  30.53 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  43.1 
 
 		 202 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  35.9 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  29.63 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  45.45 
 
 		 441 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  35.06 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2527  TonB family protein  37.1 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700162  normal  0.957554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  31.75 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  45.1 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  27.03 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  40.26 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  40 
 
 		 489 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  29.49 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  33.77 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  30.43 
 
 		 654 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3297  TonB family protein  29.35 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2895  TonB family protein  29.35 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  37.74 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  27.85 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  28.85 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  42 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.73 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  36.73 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  25 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  29.63 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  26.86 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  38.33 
 
 		 241 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  37.93 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  36.54 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  26.19 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  36.54 
 
 		 274 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>