93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1470 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  51.41 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  39.34 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  37 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  33.21 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  31.56 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  38.55 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  31.25 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  45.71 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  43.31 
 
 		 506 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  46.55 
 
 		 156 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  44.76 
 
 		 804 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  46.67 
 
 		 472 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  30.25 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  28.18 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  41.53 
 
 		 150 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  45.19 
 
 		 156 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  44.95 
 
 		 230 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  41.44 
 
 		 668 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  47.12 
 
 		 484 aa  92.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  47.12 
 
 		 485 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  45.26 
 
 		 438 aa  89.7  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  42.27 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  47.12 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  41.05 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  37.62 
 
 		 604 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  43.96 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  33.66 
 
 		 143 aa  78.2  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  40 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  43.48 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  33.72 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  35.65 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  35 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  30.77 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36.52 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.5 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  24.88 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  33.33 
 
 		 122 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  32.2 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.14 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.24 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  30.48 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  28.04 
 
 		 145 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  36.26 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.41 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  30.77 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  27.86 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  35.9 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  30.77 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35.06 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  28.57 
 
 		 446 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2309  hypothetical protein  47.5 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021914 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  32.1 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  29.49 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  35.16 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  33.73 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  36.36 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  37.74 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  30.26 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  33.73 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  29.76 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  28.04 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  30.77 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  30.26 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  30.77 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  28.92 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  34.12 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  29.57 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.77 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.36 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.38 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  30.11 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  30.77 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.07 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  29.03 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  29.84 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  27.71 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  28.95 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0798  TonB family protein  29.79 
 
 		 142 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  28.81 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  31.33 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  28.81 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  29.84 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  28.17 
 
 		 217 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  29.03 
 
 		 242 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  29.66 
 
 		 244 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>