19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01190 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01190  TonB  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  39.17 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  54.24 
 
 		 467 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06335  hypothetical protein  30.28 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  25.17 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  32.2 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  33.05 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  36.36 
 
 		 804 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  35.53 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  33.82 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  34.85 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  38.16 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  36.23 
 
 		 583 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  28.04 
 
 		 702 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  39.44 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  31.06 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  32.43 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04935  hypothetical protein  27.46 
 
 		 156 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.51886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  27.97 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>