152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0459 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  61.36 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  48.65 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  44.44 
 
 		 447 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  47.17 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34.35 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  46.6 
 
 		 288 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  34.66 
 
 		 804 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  43.24 
 
 		 506 aa  91.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  42.16 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  42.45 
 
 		 472 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  42.61 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  45.36 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  41.9 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  43.69 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  39.81 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  35.29 
 
 		 413 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  40 
 
 		 604 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  37.61 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  34.31 
 
 		 438 aa  75.5  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  34.23 
 
 		 668 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  43.75 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  41.3 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  34.86 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  38.83 
 
 		 485 aa  72  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  37.5 
 
 		 583 aa  72  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  31.93 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  38.1 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  32.54 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  42.67 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  28.51 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.16 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  24.14 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  42.11 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  36.63 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  41.33 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  38.67 
 
 		 112 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  35 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  35.05 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  35 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  37.78 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  38.96 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  38.67 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  34.65 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  39.19 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  43.84 
 
 		 507 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  30.6 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  40 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  35.56 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  36.84 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  37.33 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  35.53 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  40.79 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  44.44 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  35.53 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  34.72 
 
 		 121 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  34.67 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  38.16 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.89 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  40.54 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  36.49 
 
 		 357 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  36.92 
 
 		 349 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.33 
 
 		 270 aa  51.6  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  37.18 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.89 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.84 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  34.21 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.89 
 
 		 565 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  25.3 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  29.29 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.16 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.16 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.06 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.21 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  39.29 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  36.9 
 
 		 244 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  33.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.67 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  35.53 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  34.67 
 
 		 467 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  38.67 
 
 		 342 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  34.67 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.21 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  38.96 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  34.67 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  25.35 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  34.67 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  38.18 
 
 		 292 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  34.67 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  34.67 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  34.67 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  34.67 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  35.53 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.06 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  36 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  36.84 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.21 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>