More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3381 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  100 
 
 		 506 aa  1043    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  40.05 
 
 		 472 aa  276  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  44.88 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  43.77 
 
 		 583 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  30.02 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  31.97 
 
 		 668 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  39.83 
 
 		 804 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  30.05 
 
 		 379 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  60.98 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  25.32 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  26.3 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  54.84 
 
 		 274 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  24.83 
 
 		 438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  50.93 
 
 		 276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  31.51 
 
 		 601 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  47.01 
 
 		 156 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  44.54 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  45.95 
 
 		 150 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  54.63 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  27.54 
 
 		 621 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  47.22 
 
 		 288 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  52.68 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  48.57 
 
 		 156 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  43.31 
 
 		 279 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 563 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  47.31 
 
 		 143 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  44.86 
 
 		 279 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  50 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  26.84 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  28.81 
 
 		 583 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  39.25 
 
 		 230 aa  97.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  41.38 
 
 		 325 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  28.99 
 
 		 672 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  35.53 
 
 		 267 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  27.91 
 
 		 524 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  28.72 
 
 		 624 aa  93.6  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.36 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  26.17 
 
 		 529 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  36.36 
 
 		 222 aa  87  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  47.25 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  25.17 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  31.86 
 
 		 143 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  32.75 
 
 		 172 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  37.61 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.29 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  26.88 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  33.96 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  31.15 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  37.84 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  26.36 
 
 		 417 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1203 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 1101 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  37.86 
 
 		 986 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  46.48 
 
 		 1036 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 1014 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1059 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 1120 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1063 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 1080 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  41.46 
 
 		 1006 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1099 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  38.38 
 
 		 1007 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  25 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1006 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  42.11 
 
 		 1008 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  38.61 
 
 		 1128 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  39 
 
 		 1009 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  43.75 
 
 		 994 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1152 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  36.05 
 
 		 250 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  42.62 
 
 		 1177 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 		 1077 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  41.77 
 
 		 1163 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  40.21 
 
 		 1129 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1014 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  40.79 
 
 		 1053 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1763  TonB-dependent receptor plug  43.84 
 
 		 170 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.29 
 
 		 122 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1147 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  40 
 
 		 1023 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 1055 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 1093 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  39.22 
 
 		 1041 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  41.67 
 
 		 1122 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  37.35 
 
 		 1034 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  37.86 
 
 		 1039 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1034 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  40.45 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  49.09 
 
 		 1051 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  38.2 
 
 		 975 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1012 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 1093 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  39.74 
 
 		 1116 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  48.21 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  47.06 
 
 		 1047 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  43.48 
 
 		 1047 aa  55.1  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  41.03 
 
 		 1049 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  38.83 
 
 		 1102 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>