112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0606 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  100 
 
 		 325 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  38.87 
 
 		 583 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  33.07 
 
 		 604 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  41.38 
 
 		 506 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  41.84 
 
 		 804 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  44.21 
 
 		 143 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  41.96 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  40.86 
 
 		 413 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  44.09 
 
 		 230 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  38.54 
 
 		 150 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  37.19 
 
 		 274 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  42.27 
 
 		 279 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  41.67 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  34.86 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  40.62 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  47.06 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  37.5 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  43.96 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  36.07 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  43.01 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  38.89 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  34.69 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  32.43 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  41.76 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  30.83 
 
 		 156 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  36.44 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  28.08 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  36.45 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  35.56 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  29.75 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.29 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.92 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  34.02 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.34 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  44 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  33.02 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  31.78 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  42.5 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  30.77 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  31.93 
 
 		 702 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  40.54 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  31.39 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  38.16 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  36.99 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  28.74 
 
 		 122 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  31.78 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  41.56 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.49 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  27.89 
 
 		 507 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  37.66 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  31.4 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  39.47 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.62 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  33.33 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  39.19 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  38.16 
 
 		 268 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  37.18 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  40 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  43.08 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  35.58 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  34.52 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  27.64 
 
 		 467 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  33.33 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  42.59 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1089 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0687  TonB-like protein  48 
 
 		 225 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  35.62 
 
 		 121 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  43.33 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  36.49 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.68 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.43 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  37.88 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1109 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1161 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.22 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  35.09 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1040 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  22.61 
 
 		 1108 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  52.17 
 
 		 780 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  40 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  36 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  34 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1043 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  34 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  34 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  32.43 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1033 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  39.39 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  41.82 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  41.38 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  41.82 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 994 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1011 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  31.48 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  33.96 
 
 		 232 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  33.78 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  43.55 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  32.47 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  36 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>