35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2717 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  34.29 
 
 		 274 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  34.78 
 
 		 668 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  36.11 
 
 		 484 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  37.21 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  34.78 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  31.18 
 
 		 804 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  31.48 
 
 		 274 aa  60.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  37.88 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  29.06 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  37.78 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  30.97 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  29.29 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  28.26 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  29.37 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  29.35 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  33.33 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  28.74 
 
 		 325 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  34.48 
 
 		 279 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  33.33 
 
 		 258 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  30.11 
 
 		 489 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  26.23 
 
 		 485 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  25.53 
 
 		 604 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  29.89 
 
 		 413 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  24.73 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  29.07 
 
 		 267 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  29.07 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  25.81 
 
 		 472 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  27.62 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  29.27 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  32 
 
 		 276 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  25.58 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  26.74 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  34.72 
 
 		 274 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>