More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6188 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  100 
 
 		 804 aa  1644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  36.91 
 
 		 604 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  33.82 
 
 		 583 aa  251  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  30.56 
 
 		 668 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  39.83 
 
 		 506 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  42.23 
 
 		 472 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  28.65 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  47.02 
 
 		 274 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  45.81 
 
 		 276 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  48.85 
 
 		 274 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  28.88 
 
 		 601 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  39.07 
 
 		 156 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  49.14 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 621 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  29.55 
 
 		 647 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  29.35 
 
 		 515 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  41.73 
 
 		 275 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  30.51 
 
 		 447 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  30.53 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  51.46 
 
 		 156 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  50.54 
 
 		 143 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  39.61 
 
 		 288 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  50.98 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  45.79 
 
 		 279 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  46.39 
 
 		 379 aa  107  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  32.07 
 
 		 413 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  29.97 
 
 		 529 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  44.76 
 
 		 279 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  28.8 
 
 		 524 aa  104  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  31.7 
 
 		 583 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  44.04 
 
 		 230 aa  103  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  29.89 
 
 		 624 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  36.69 
 
 		 438 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  42.71 
 
 		 325 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  42.48 
 
 		 485 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  42.55 
 
 		 267 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  45.83 
 
 		 489 aa  91.3  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 672 aa  91.3  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  43 
 
 		 222 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  30.16 
 
 		 143 aa  82  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40 
 
 		 258 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  41.76 
 
 		 221 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  34.91 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  38.95 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.87 
 
 		 447 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  31.07 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  37.23 
 
 		 172 aa  71.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  44.71 
 
 		 986 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  46.25 
 
 		 1144 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  48.57 
 
 		 1057 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  53.12 
 
 		 1034 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  46.67 
 
 		 1095 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  45.12 
 
 		 1148 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  47.83 
 
 		 1047 aa  65.1  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  46.91 
 
 		 1033 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  47.37 
 
 		 1006 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  53.85 
 
 		 1016 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 1086 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  43.75 
 
 		 1102 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  46.58 
 
 		 1164 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1127 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  49.25 
 
 		 1096 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  27.97 
 
 		 223 aa  62  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  47.76 
 
 		 1095 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1071 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  43.02 
 
 		 1012 aa  62  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  46.75 
 
 		 1005 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  31.18 
 
 		 122 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  50.77 
 
 		 1037 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  40.96 
 
 		 1036 aa  61.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  46.27 
 
 		 1033 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  44.74 
 
 		 1019 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  49.25 
 
 		 1026 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  46.15 
 
 		 1161 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  55.17 
 
 		 1101 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  45.57 
 
 		 1017 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  48.21 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  46.58 
 
 		 1128 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  43.42 
 
 		 1060 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1012 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  28.57 
 
 		 238 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  39.24 
 
 		 1034 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  49.21 
 
 		 1064 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  42.11 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  42.68 
 
 		 1011 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  36.14 
 
 		 1230 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  43.21 
 
 		 1139 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  44.44 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  48.53 
 
 		 1127 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  46.38 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 1043 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  47.46 
 
 		 1085 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 996 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  53.7 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  47.69 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  54.39 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  36.36 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  48.48 
 
 		 1122 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  45.33 
 
 		 1026 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>