64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1363 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 379 aa  770    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  30.05 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  38.31 
 
 		 624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  31.99 
 
 		 472 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  36.26 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  27.65 
 
 		 438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  27.03 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  53.4 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  49.53 
 
 		 668 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  49.52 
 
 		 156 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  52.17 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  47.92 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  46.39 
 
 		 804 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  47.27 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  30.29 
 
 		 515 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  99.4  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  42.4 
 
 		 172 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.51 
 
 		 604 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  26.19 
 
 		 672 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  28.45 
 
 		 583 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  27.55 
 
 		 563 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  35.11 
 
 		 143 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  42.86 
 
 		 150 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  42.39 
 
 		 274 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  27.87 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  40.22 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  26.69 
 
 		 647 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 529 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  27.05 
 
 		 467 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  43.62 
 
 		 222 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  35.9 
 
 		 484 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  25.55 
 
 		 601 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  27.4 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  43.96 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  41.94 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40.45 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  35.2 
 
 		 143 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  41 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  39.53 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  37.11 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  39.56 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  29.59 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  29.48 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  25.32 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  37.88 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.05 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.44 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36.67 
 
 		 238 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  33.33 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  23.64 
 
 		 447 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  28.67 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0076  hypothetical protein  28.43 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0823761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  23.98 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  40 
 
 		 249 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  23.41 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  31.16 
 
 		 702 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  30.38 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  22.44 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  32.86 
 
 		 541 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1122 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  24.4 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  18.68 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  28.4 
 
 		 245 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  26.03 
 
 		 145 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>