284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0579 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 541 aa  1097    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  36.54 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  26.29 
 
 		 590 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  26.83 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  37.88 
 
 		 423 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.79 
 
 		 858 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  29.09 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  28.51 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  31.68 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  28 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 		 1021 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  38.32 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1585 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  30.06 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0005  Ankyrin  44.19 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0136413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  33.58 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  27.14 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  25.11 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  35.17 
 
 		 1116 aa  67.8  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  36.61 
 
 		 1061 aa  67.4  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  28.4 
 
 		 302 aa  67  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.81 
 
 		 660 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  22.03 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  22.03 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  22.03 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  28.85 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1402 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  35.96 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  28.48 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  35.1 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  40 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  29.03 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  21.56 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  35.96 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.03 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  29.81 
 
 		 1156 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  27.13 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.2 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  26.53 
 
 		 651 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  30.23 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  33.88 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  37.42 
 
 		 1977 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  35.16 
 
 		 157 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  36.04 
 
 		 821 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  38.84 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  26.3 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  35.66 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  39.56 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  31.61 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  33.64 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  43.56 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  30.54 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  43.62 
 
 		 870 aa  61.2  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  21.4 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  32.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1249 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.06 
 
 		 731 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 		 1622 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  31.71 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  31.25 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.5 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  36.45 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  31.01 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  26.52 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  33.93 
 
 		 719 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  31.2 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  46.15 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1005 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  33.65 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  28.14 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  32.65 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  31.63 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  30.07 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 		 1198 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  29.32 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  35.87 
 
 		 2171 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  32.46 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  30.49 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  29.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  35.19 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  32.65 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  28.18 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  29.32 
 
 		 289 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  36.7 
 
 		 369 aa  57  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 		 1133 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  25.54 
 
 		 227 aa  57  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1317  hypothetical protein  33.61 
 
 		 536 aa  57  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  32.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  32.65 
 
 		 196 aa  57  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 		 766 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  39.13 
 
 		 195 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  32.65 
 
 		 196 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  29.94 
 
 		 4520 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  28.57 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  31.63 
 
 		 196 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  28.57 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.08 
 
 		 728 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  28.57 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>