52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4715 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 465 aa  906    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.07 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  33.33 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 651 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.52 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  30.77 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  22.52 
 
 		 750 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  26.37 
 
 		 671 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  32.03 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  31.1 
 
 		 581 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  33.13 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  39.51 
 
 		 660 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  26.11 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  33.06 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  21.13 
 
 		 562 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  29.46 
 
 		 631 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  28.57 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  23.11 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  23.99 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  19.77 
 
 		 632 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  20.35 
 
 		 858 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  24.17 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  20.71 
 
 		 632 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  27.12 
 
 		 596 aa  53.9  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  18.81 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  18.81 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  30.56 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  24.27 
 
 		 719 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  30.84 
 
 		 754 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  34.38 
 
 		 664 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  36.7 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  29.09 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  26.9 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  31.82 
 
 		 379 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.61 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  27.05 
 
 		 649 aa  50.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.7 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  20.3 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  18.6 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  21.21 
 
 		 640 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  21.32 
 
 		 728 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  18.6 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  18.6 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  27.2 
 
 		 519 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  36.28 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  26.92 
 
 		 747 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2522  peptidase M56, BlaR1  29.37 
 
 		 326 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  26.63 
 
 		 614 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  29.38 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  32.05 
 
 		 270 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  27.06 
 
 		 413 aa  43.9  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>