69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1934 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 647 aa  1333    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  33.25 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  29.49 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  24.68 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  26.14 
 
 		 750 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  24.11 
 
 		 617 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  25.49 
 
 		 519 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.05 
 
 		 858 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  22.87 
 
 		 747 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  28.61 
 
 		 728 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.94 
 
 		 632 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  26.5 
 
 		 719 aa  97.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  23.15 
 
 		 629 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  23.15 
 
 		 629 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  26.1 
 
 		 442 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  28.16 
 
 		 562 aa  92  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  22.84 
 
 		 619 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  22.6 
 
 		 640 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  24.54 
 
 		 614 aa  87.8  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  24.91 
 
 		 754 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  27.05 
 
 		 413 aa  87.4  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.46 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  26.46 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  24.85 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  26.64 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.2 
 
 		 404 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  35.04 
 
 		 405 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  34.81 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.85 
 
 		 417 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.54 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  26.03 
 
 		 423 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  25.78 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  25.27 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  25.11 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  24.15 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  28.87 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  22.07 
 
 		 557 aa  67  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  26.88 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  22.67 
 
 		 660 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  29.88 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  25.44 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  23.21 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  23.98 
 
 		 700 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  26.35 
 
 		 750 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  34.48 
 
 		 403 aa  60.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  25.62 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  24.22 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  24.22 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  24.22 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  26.67 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  31.11 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  27.59 
 
 		 299 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  25 
 
 		 482 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  24.88 
 
 		 379 aa  53.9  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  30.47 
 
 		 515 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  24.34 
 
 		 509 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2059  hypothetical protein  27.41 
 
 		 203 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0850085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  29.85 
 
 		 596 aa  51.6  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  21.65 
 
 		 585 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  19.95 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  28.81 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  24.03 
 
 		 413 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  26.56 
 
 		 601 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  25.55 
 
 		 563 aa  48.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  20.69 
 
 		 585 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1843  hypothetical protein  31.9 
 
 		 319 aa  47.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.17396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  37.5 
 
 		 210 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  28.85 
 
 		 381 aa  44.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  24.12 
 
 		 624 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>