64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1355 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 519 aa  1058    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0365  hypothetical protein  61.64 
 
 		 206 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1356  hypothetical protein  51.23 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  26.04 
 
 		 647 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  26.71 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  29.19 
 
 		 632 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25.98 
 
 		 858 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  22.37 
 
 		 617 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.45 
 
 		 405 aa  94.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  23.18 
 
 		 750 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  26.37 
 
 		 614 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  21.32 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.11 
 
 		 728 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.29 
 
 		 462 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  25.09 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.65 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  22.22 
 
 		 750 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  25.16 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  25.16 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  25.16 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  35.77 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  21.99 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  21.99 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.99 
 
 		 632 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.57 
 
 		 619 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  26.7 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  23.2 
 
 		 747 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  22.94 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  30.1 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  24.11 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  25.66 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  24.69 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  21.18 
 
 		 640 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  24.85 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.4 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  30.07 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  24.77 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  27.33 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  18.13 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  23.56 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  22.41 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  26.67 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  25.3 
 
 		 660 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  26.14 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  23.95 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  23.35 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  23.2 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  19.86 
 
 		 557 aa  57  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  23.84 
 
 		 651 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  28.91 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  23.22 
 
 		 649 aa  54.3  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  28.68 
 
 		 596 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  28.3 
 
 		 299 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  29.7 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  22.74 
 
 		 585 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  35.62 
 
 		 380 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  25.64 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  21.14 
 
 		 361 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3151  heat shock protein HtpX  29.2 
 
 		 309 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  26.56 
 
 		 405 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  41.43 
 
 		 210 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  30.83 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>