38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2423 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 380 aa  764    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  37.19 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1589  hypothetical protein  26.29 
 
 		 636 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1404  hypothetical protein  27.18 
 
 		 636 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0076  hypothetical protein  26.36 
 
 		 640 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0823761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  34.62 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  27.43 
 
 		 671 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  29.19 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  31.15 
 
 		 581 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  30.48 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  35.62 
 
 		 519 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  31.18 
 
 		 598 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  32.99 
 
 		 631 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  24.64 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  23.33 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  27.01 
 
 		 590 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  28.07 
 
 		 617 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  35.23 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  29.94 
 
 		 640 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  28.87 
 
 		 509 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  30.23 
 
 		 750 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  35.14 
 
 		 700 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.28 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  35.62 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  32.98 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  27.62 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  29.63 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  28.05 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  27.33 
 
 		 629 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  27.33 
 
 		 629 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  28.57 
 
 		 583 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.22 
 
 		 632 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  31.08 
 
 		 858 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  30.23 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  23.31 
 
 		 541 aa  42.7  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  31.43 
 
 		 660 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>