99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6521 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  100 
 
 		 413 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  30.02 
 
 		 506 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.77 
 
 		 472 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  26.44 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  25.12 
 
 		 438 aa  142  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  27.03 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  56.07 
 
 		 279 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.52 
 
 		 604 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  45.71 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  24.72 
 
 		 668 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  40.71 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  37.31 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  27.86 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  43.1 
 
 		 150 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  32.91 
 
 		 156 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  24.23 
 
 		 583 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  37.93 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  28.32 
 
 		 621 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  40.91 
 
 		 804 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  26.84 
 
 		 647 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  41.9 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  38.68 
 
 		 230 aa  94.4  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  40.74 
 
 		 156 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  40.95 
 
 		 275 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  40.86 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.62 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  25.19 
 
 		 624 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  39.78 
 
 		 143 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  41.59 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  25.09 
 
 		 563 aa  82.8  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  38.74 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  27.1 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  37.86 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  35.58 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  42.71 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  24.83 
 
 		 601 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  31.09 
 
 		 143 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  43.02 
 
 		 221 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  36.11 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  22.5 
 
 		 672 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  24.66 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  23.76 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.62 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  31.09 
 
 		 145 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  23.02 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  23.76 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  39.13 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  24.15 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  40 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  34.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  23.8 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  30.91 
 
 		 238 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  21.7 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  41.54 
 
 		 239 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  25.33 
 
 		 223 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  22.75 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  27.68 
 
 		 245 aa  53.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  28.45 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  28.04 
 
 		 137 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.77 
 
 		 112 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  36.36 
 
 		 268 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  36.71 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  29.79 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  30 
 
 		 754 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  24.03 
 
 		 647 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  31.76 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  27.4 
 
 		 631 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.89 
 
 		 122 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  35.06 
 
 		 271 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  36 
 
 		 263 aa  47.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  46.15 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  33.33 
 
 		 235 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  34.12 
 
 		 236 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  20.75 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  24 
 
 		 403 aa  46.6  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  30.77 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.31 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  41.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.91 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1122 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  28.05 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  41.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  41.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.18 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  26.87 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  38.16 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  32.05 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  27.17 
 
 		 263 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  31.17 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  30.77 
 
 		 229 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  30.77 
 
 		 229 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  32.91 
 
 		 283 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 		 248 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  30.77 
 
 		 244 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  30.43 
 
 		 217 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>