213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0115 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  59.42 
 
 		 207 aa  262  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  53.4 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  52.43 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  56.48 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  41.06 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.74 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.39 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  35.05 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.56 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  38.16 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  37.09 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  38.16 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  37.91 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  37.09 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  38.16 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  36.15 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  36.15 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  36.71 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  34.33 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  33.85 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  33.85 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  36.15 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  38.86 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  35.61 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  35.61 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  35.15 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  32.83 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  33 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.68 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  34.95 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  48.31 
 
 		 131 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  29.22 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  31.47 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.55 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  36.44 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  30.2 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  27.78 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  42.57 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  40.18 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  45.35 
 
 		 392 aa  82  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  27.54 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  39.81 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  36.27 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  28.02 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  40.51 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  38.94 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  35.45 
 
 		 368 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  38.64 
 
 		 369 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  35.42 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  40.7 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.91 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  37.5 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  38.27 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  39.56 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  37.5 
 
 		 370 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  35.23 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  35.56 
 
 		 370 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  28.5 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  37.93 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  33.61 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  40.86 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  33.33 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  26.39 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  36.05 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  40 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  36.05 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  43.42 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  29.37 
 
 		 403 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  48.39 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  35.29 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  42.05 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.28 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  30.85 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  41.46 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  36.78 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  46.97 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.95 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  46.88 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  44.26 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  44.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  44.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  43.55 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  35.16 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  36.59 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  35.35 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  36.49 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  34.12 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  39.68 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  39.68 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  41.94 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.51 
 
 		 371 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  40.35 
 
 		 334 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  41.94 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  41.94 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  41.94 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  41.94 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  41.94 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  41.94 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  41.94 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>