128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1995 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  90.87 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  58.3 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  41.6 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  72.64 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  54.84 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  56.45 
 
 		 242 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  56.56 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  56.56 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  56.56 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  56.56 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  60 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  60 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  60 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  54.84 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  54.84 
 
 		 239 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  54.84 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  54.84 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  54.84 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  54.84 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  54.84 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  54.84 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  42.11 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  40 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  38.61 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  61.82 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  31.03 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  33.07 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  38.61 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  34.88 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  34.88 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  40.79 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.17 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  29.32 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  42.86 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  27.82 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  27.82 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.87 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  36.36 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  28.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  28.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  40.58 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  35.96 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  37.68 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  33.68 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  28.79 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  34.74 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  36.25 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  31.58 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.14 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.82 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  32.63 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.47 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  38.46 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  28.91 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  36.36 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  35.56 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  37.18 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  31.06 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  31.17 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  42.86 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  44.64 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  36.07 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  30.92 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  30.26 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  34.41 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.35 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30.43 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.35 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  33.75 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  34.78 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  35.44 
 
 		 405 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  37.04 
 
 		 369 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.67 
 
 		 203 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  38.64 
 
 		 93 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  34.09 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  38.27 
 
 		 371 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  32.43 
 
 		 371 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  36.62 
 
 		 370 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  46.81 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  25.76 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.43 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  38.03 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  38.03 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.68 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35.48 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.05 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.71 
 
 		 368 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  25.32 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  32.43 
 
 		 371 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  36.11 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  31.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  31.03 
 
 		 283 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  34.43 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  26.16 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  37.1 
 
 		 391 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  28.4 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  28.57 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  40 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  25.17 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>