178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1258 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  100 
 
 		 206 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  88.83 
 
 		 206 aa  332  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  87.86 
 
 		 206 aa  331  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  87.86 
 
 		 206 aa  331  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  88.89 
 
 		 207 aa  329  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  87.92 
 
 		 207 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  87.92 
 
 		 207 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  86.89 
 
 		 206 aa  327  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  86.89 
 
 		 206 aa  327  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  82.13 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  82.44 
 
 		 207 aa  308  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  83.5 
 
 		 206 aa  297  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  76.7 
 
 		 206 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  77.18 
 
 		 206 aa  288  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  79.13 
 
 		 206 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  76.96 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  59.41 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  57.64 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  59.09 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  44.17 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  36.71 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  36.57 
 
 		 207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  37.95 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  40.1 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  38.83 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  39.59 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  40.29 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  37.38 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  39.9 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  37.24 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  39.09 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  39.81 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  38.86 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  39.49 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.69 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  33 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  43.82 
 
 		 368 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  28.77 
 
 		 223 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  45.35 
 
 		 370 aa  85.5  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  37.39 
 
 		 396 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  42.35 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  34.09 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  45.35 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  45.88 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  42.86 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  44.19 
 
 		 370 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  39.37 
 
 		 404 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  46.43 
 
 		 403 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  45.45 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  40.86 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  38.02 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  43.59 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  36.84 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  42.68 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  38.1 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.27 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  38.89 
 
 		 397 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  44.19 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  53.12 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  37.08 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  27.4 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  27.23 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.47 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  39.73 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  32.99 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  34.12 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  36.78 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  37.21 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  28.29 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  32.29 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  28.29 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35.64 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  30.93 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  39.13 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.44 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  29.84 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  34.44 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  34.78 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  34.78 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  34.44 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  30.34 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  29.55 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.33 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  36.47 
 
 		 462 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  31.68 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  33.33 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  37.93 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  39.74 
 
 		 110 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.36 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  31.4 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  31.71 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  31.71 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  29.76 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  31.71 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  31.71 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  29.76 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  31.71 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  29.76 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  31.71 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>