145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03431 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  77.23 
 
 		 202 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  61 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  40.59 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35.14 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  30.05 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  32.37 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30.24 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  31.46 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.77 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  31.68 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  30.92 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30.85 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  30.96 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  32.39 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  33 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  30.96 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.93 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  31.84 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  31.92 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  31.92 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  31.07 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  34.63 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  32.37 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  31.82 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  33.66 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  33.5 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  29.95 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  31.82 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  29.95 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  31.68 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  31.4 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  44.44 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  39.8 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  31.63 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  33.5 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  29.41 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  31.19 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  27.98 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.15 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  43.82 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3238  tonB protein, putative  42.05 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  26.92 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  26.98 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0113  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.2 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.158306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  44.44 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.62 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  39.02 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  35.79 
 
 		 244 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  39.19 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  35.06 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  27.43 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.4 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  33.72 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  36.05 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  44.29 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  47.46 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  41.79 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  40.54 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  32.94 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  32.94 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  35.48 
 
 		 458 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  28.75 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  26.42 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  34.72 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  28.24 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  32.65 
 
 		 368 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  31.58 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  33.87 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.14 
 
 		 391 aa  54.7  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  34.88 
 
 		 370 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  26.51 
 
 		 405 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  31.71 
 
 		 369 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  32.26 
 
 		 255 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  32.94 
 
 		 404 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  37.5 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  43.28 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  38.1 
 
 		 371 aa  51.6  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  33.33 
 
 		 392 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  32.84 
 
 		 397 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.25 
 
 		 367 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  35.11 
 
 		 565 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  34.15 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  38.1 
 
 		 371 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  37.68 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.91 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  31.71 
 
 		 354 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  36.51 
 
 		 349 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  31.94 
 
 		 361 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.72 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  40.32 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  34.94 
 
 		 582 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  36.51 
 
 		 334 aa  48.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  38.1 
 
 		 340 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.46 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  42 
 
 		 93 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.46 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>