210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3705 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  42.75 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  32.44 
 
 		 390 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  43.48 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  44.68 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  41.28 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  41.67 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  40.62 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  44.05 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  38.54 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  36.47 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  39.05 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  38.95 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  39.81 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.62 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.67 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.17 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.17 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  37.78 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  37.78 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  32.41 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.17 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.17 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  50.75 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  41.03 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  38.3 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  36.63 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  37.23 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  50 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  35.42 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  43.53 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  40.2 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  38.46 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  48.44 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  30.67 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  34.78 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  35.42 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  34.38 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  48.44 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  32.41 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  51.56 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  36.67 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.48 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  35.96 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  33.33 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  44.44 
 
 		 115 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  33.68 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  39.44 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  38.81 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  38.46 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.87 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  38.57 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  34.07 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  32.94 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  38.3 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  35.23 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  32 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  31.4 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  41.67 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  42.25 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  49.09 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  41.67 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  36.36 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  35.23 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  42.25 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.07 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  36.36 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  40.85 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  36.71 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  39.44 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  33.71 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  35.44 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  33.33 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  29.11 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  36.36 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  33.71 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  33.71 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  36.36 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  36.36 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  35.44 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  36.36 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  36.36 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  36.36 
 
 		 239 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  36.36 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  33.71 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  36.36 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  39.68 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  36.36 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  38.46 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  39.68 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  35.9 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  33.71 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  32.58 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  41.03 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  41.03 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  36.47 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  33.73 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.05 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  35.71 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>