153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3842 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  45.63 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  42.55 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  38.98 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  42.55 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  42.67 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  39.29 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  42.67 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  39.56 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  39.08 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  41.56 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.71 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  37.36 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.8 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.8 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  35.16 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  37.08 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.69 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.79 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.43 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  35.9 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.39 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.17 
 
 		 459 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  30.95 
 
 		 700 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  30.25 
 
 		 417 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  29.37 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  36.05 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.88 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  40.26 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  33.71 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  32.97 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  39.44 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  33.33 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  36.36 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  35.87 
 
 		 308 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  30.77 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  27.08 
 
 		 270 aa  51.6  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.29 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.82 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  30.77 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  43.04 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  35.82 
 
 		 467 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  31.17 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  30.43 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  32.38 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  39.06 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  39.06 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  39.06 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  43.55 
 
 		 371 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  34.07 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.46 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  43.55 
 
 		 371 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  33.65 
 
 		 283 aa  49.3  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  32.73 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  36.84 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  46.55 
 
 		 334 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  33.7 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  31.87 
 
 		 273 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  30.97 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  37.5 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  40.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  38.46 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  32.38 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  40.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  35.23 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  40.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  40.3 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  40.3 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  32.17 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  40.3 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  31.58 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  32.38 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  39.06 
 
 		 108 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  40.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  40.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  31.91 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  40.3 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  39.06 
 
 		 108 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  34.85 
 
 		 349 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.33 
 
 		 115 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  32.18 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  36.92 
 
 		 363 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  40 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  34.52 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  31.58 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  31.58 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  29.87 
 
 		 804 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  31.43 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  28.92 
 
 		 342 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.33 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  31.58 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  36.25 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  32 
 
 		 288 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  28.57 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  35.79 
 
 		 865 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  29.36 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  31.88 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  38.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>