148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2766 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  100 
 
 
249 aa  484  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.54 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  51.04 
 
 
269 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  54.44 
 
 
283 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  43.1 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  40.62 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.82 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  39.08 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  39.08 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  39.08 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  39.08 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  38.67 
 
 
472 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  38.64 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.83 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  41.33 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  38.37 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  29.34 
 
 
390 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  41.56 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  39.19 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  37.65 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  35.71 
 
 
285 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.75 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  34.52 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35 
 
 
112 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  39.51 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  29 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  37.5 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  34.31 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  42.31 
 
 
441 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  37.5 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  30.59 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  38.46 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  38.16 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  38.1 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  38.96 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  37.65 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  31.63 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  35.53 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  38.46 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  31.85 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  37.84 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.33 
 
 
289 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  31.63 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.95 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  31.63 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  31.63 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  31.63 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  31.63 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  31.63 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  33.33 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  32.29 
 
 
227 aa  52  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  39.44 
 
 
269 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.06 
 
 
245 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  28.9 
 
 
275 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  38.96 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  29.01 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  38.36 
 
 
143 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.52 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  38.96 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  35.63 
 
 
367 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  33.77 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  32.47 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  37.18 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  40 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  38.96 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  32.94 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  44.44 
 
 
860 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  30.38 
 
 
121 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  32.1 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  29.87 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  32.97 
 
 
668 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  37.18 
 
 
804 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.78 
 
 
447 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  36.84 
 
 
506 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  40 
 
 
379 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  37.66 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  32.14 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.41 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  32.89 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2023  hypothetical protein  46.3 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.374648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  30.88 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  35.82 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  31.65 
 
 
117 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  36.76 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  35.44 
 
 
134 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  35.21 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  26 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  31.82 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  43.42 
 
 
865 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  42.47 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  40 
 
 
906 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  35.53 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  27.64 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  35 
 
 
255 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  41.56 
 
 
859 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.21 
 
 
220 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  28.47 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36.49 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  35.53 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>