207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4093 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  100 
 
 		 228 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  43.38 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  66.67 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  43.87 
 
 		 287 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.33 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  58.43 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  41.56 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  51.72 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  52.87 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  49.43 
 
 		 256 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  49.43 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  50 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  49.43 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  50.57 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  47.13 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  50.57 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  48.35 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  43.33 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  50 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  48.84 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  48.84 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  45.3 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  48.84 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  49.43 
 
 		 274 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  50 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  49.43 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  50 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  45.3 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  49.43 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  51.19 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  48.84 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  45.98 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  47.25 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  48.35 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  49.41 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  46.43 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  51.76 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  39.77 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  51.16 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  44.3 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  51.16 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  50.59 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  37.82 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.41 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.6 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.92 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  44.44 
 
 		 117 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  41.67 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  41.67 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  41.56 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  44.83 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.97 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  39.6 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  46.15 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  36.14 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  40.23 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  30.69 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  44.93 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  37.04 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  39.76 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.67 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  41.03 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  40.26 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.26 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  34.88 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.26 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  40.26 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  41.03 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  36.25 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  37.5 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  36.25 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.36 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.72 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.57 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  36.78 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  34.44 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  29.41 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  32.46 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  33.71 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.41 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  41.43 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  29.58 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.35 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.03 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  37.18 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  34.78 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  35.37 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  39.29 
 
 		 475 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  39.24 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  29.13 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  36.59 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  36.59 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  36.59 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  33.73 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  29.03 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  39.74 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  34.69 
 
 		 140 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  38.16 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  38.16 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>