51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0761 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  100 
 
 		 247 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  37.7 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  44.44 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  45.76 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.03 
 
 		 2449 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  44.44 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  38.96 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  39.13 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  44.9 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  44.07 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  47.46 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  40 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  40 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  48.89 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  36.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  45.28 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  38.33 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  48 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  38.33 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  52.27 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.41 
 
 		 1888 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  38.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.33 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.33 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.77 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  38.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  36.25 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  36.23 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  40.98 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  46.81 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  48.39 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  31.18 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  31.18 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  44.23 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  47.06 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  34.29 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  47.73 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  34.29 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  34.29 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  38.33 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.93 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  33.33 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  40.43 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  36.84 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  46.81 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  42.55 
 
 		 475 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40.85 
 
 		 117 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  35.82 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  32.61 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  36.67 
 
 		 236 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  35.09 
 
 		 234 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>