53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0017 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  100 
 
 
220 aa  433  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0808  TonB-like protein  46.58 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.656217  hitchhiker  0.00924999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0117  TonB family protein  45 
 
 
215 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0739  TonB-like  42.53 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  40.51 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.9 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  37.5 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  36.25 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  37.66 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  47.27 
 
 
267 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  38.06 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  45.45 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  28.1 
 
 
297 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  40.32 
 
 
274 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  41.18 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.14 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  31.73 
 
 
295 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.44 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  38.46 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  40.35 
 
 
138 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  40 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  43.86 
 
 
279 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0458  hypothetical protein  23.66 
 
 
319 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  27.27 
 
 
319 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  36.23 
 
 
441 aa  45.1  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  44 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  30.51 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  42 
 
 
317 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  30.08 
 
 
475 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  42.11 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  36.47 
 
 
337 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  43.28 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  32.58 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  32.08 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  37.68 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  37.93 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  40.82 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  32.1 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  38.33 
 
 
349 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  37.68 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  44.44 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  34.57 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.29 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  37.29 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.48 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  38 
 
 
243 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  28.33 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  38 
 
 
226 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  44.74 
 
 
262 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  42.86 
 
 
293 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  36.07 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1117  hypothetical protein  47.62 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.53 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>