269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4047 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  46.15 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  41.38 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  47.95 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  47.95 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  47.95 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  44.87 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  47.95 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  47.95 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  45.78 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  47.95 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  47.95 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  39.39 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  44.74 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  40.51 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  45.21 
 
 		 117 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  39.74 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  42.53 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  44.71 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  41.03 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  50.62 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  41.03 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  42.53 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  44.05 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  40.26 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  41.77 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.53 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  43.02 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  29.41 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  41.77 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  34.26 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  36.47 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  38.96 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  38.96 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  38.96 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  38.96 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  38.96 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.97 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  44.3 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  40.26 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  36.04 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  46.84 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  52.24 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.96 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  38.96 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.46 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  35.71 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  38.46 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  40.26 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.75 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  44.87 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  37.78 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  29.79 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  27.42 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  35 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  37.18 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30.67 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  32.26 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.89 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.67 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  34.62 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  40.79 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  28 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  34.62 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  41.18 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  41.18 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  34.62 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  34.12 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  36.36 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  40.85 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  37.18 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  38.24 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.24 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  32.58 
 
 		 700 aa  55.1  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  31.58 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.03 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  28.08 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  48.21 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  35.48 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  41.25 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  34.62 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  34.62 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  27.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  36.84 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  36.36 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  27.68 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1374  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.62 
 
 		 2751 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  32.04 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  33.7 
 
 		 288 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  34.41 
 
 		 614 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  29.91 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  32.05 
 
 		 367 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  40.38 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  40 
 
 		 295 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  41.79 
 
 		 342 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.3 
 
 		 582 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  36.08 
 
 		 170 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  36.08 
 
 		 170 aa  52  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>