160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3133 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  100 
 
 
342 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  61.68 
 
 
298 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  68.34 
 
 
332 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  48.28 
 
 
150 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  36.05 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.79 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  38.04 
 
 
244 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  45.33 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.48 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  36.9 
 
 
565 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  33.56 
 
 
285 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  38.2 
 
 
357 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.86 
 
 
117 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  35.87 
 
 
614 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  38.96 
 
 
215 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  31.71 
 
 
112 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.48 
 
 
244 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  36 
 
 
447 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.48 
 
 
244 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  38.1 
 
 
134 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  38.78 
 
 
210 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  39.24 
 
 
276 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  39.47 
 
 
668 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  39.02 
 
 
237 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 
582 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.44 
 
 
233 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  38.67 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  34.12 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  37.97 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.94 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.77 
 
 
208 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  33.33 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  38.16 
 
 
274 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  39.24 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  37.08 
 
 
506 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  37.5 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  32.06 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  35.53 
 
 
156 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  39.24 
 
 
244 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  32.1 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.43 
 
 
121 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30.7 
 
 
193 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  29.41 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  33.33 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.84 
 
 
269 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  32.58 
 
 
227 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  34.62 
 
 
244 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  35.37 
 
 
140 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  35.78 
 
 
248 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  36.84 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  34.18 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  37.93 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.21 
 
 
604 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  34.18 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  31.71 
 
 
137 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  31.71 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  28 
 
 
223 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.96 
 
 
221 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.96 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  32.32 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  26.09 
 
 
259 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  34.88 
 
 
212 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.59 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  32.22 
 
 
489 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.97 
 
 
441 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  32.93 
 
 
138 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  33.33 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  32.91 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.12 
 
 
206 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  36.71 
 
 
234 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  35.29 
 
 
865 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  37.31 
 
 
206 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  33.77 
 
 
391 aa  49.7  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  34.18 
 
 
274 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  33.77 
 
 
215 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.37 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  31.58 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  29.27 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  27.72 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  34.44 
 
 
860 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  36.36 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  35.53 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  32.95 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  31.03 
 
 
804 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  35.16 
 
 
859 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  36.71 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  36.36 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  34.78 
 
 
271 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  31.65 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  32.91 
 
 
271 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  29.89 
 
 
325 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  32.89 
 
 
472 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.89 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  33.77 
 
 
250 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  33.77 
 
 
390 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  32.91 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.33 
 
 
289 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  34.09 
 
 
160 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.06 
 
 
334 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>