23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4592 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  100 
 
 
227 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  61.54 
 
 
241 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  31.68 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  30 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  30.61 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  29.41 
 
 
332 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.63 
 
 
2449 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  32.58 
 
 
342 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.87 
 
 
112 aa  45.1  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  24.6 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  24.6 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  30.23 
 
 
138 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  34.18 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  34.18 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  33.82 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.46 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  28.92 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  28.92 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.33 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  24.12 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.79 
 
 
249 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  25.58 
 
 
276 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  30.77 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>