82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1009 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  100 
 
 		 565 aa  1132    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  31.19 
 
 		 466 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  43.02 
 
 		 220 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2647  TonB family protein  31.75 
 
 		 266 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0201451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.33 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  27.62 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  32.34 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  27.8 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  42.53 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  39.08 
 
 		 227 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  41.03 
 
 		 217 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  41.77 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.95 
 
 		 112 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  36.73 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  28.19 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  35.71 
 
 		 134 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.95 
 
 		 259 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  36.47 
 
 		 277 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.16 
 
 		 269 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  38.37 
 
 		 225 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.78 
 
 		 390 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  32.98 
 
 		 238 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  34.34 
 
 		 391 aa  54.3  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  36.47 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.29 
 
 		 258 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  30.95 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.02 
 
 		 368 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  31.76 
 
 		 700 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  32.91 
 
 		 121 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  36.9 
 
 		 342 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  35.87 
 
 		 202 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  30.51 
 
 		 223 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.44 
 
 		 270 aa  51.2  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  36.51 
 
 		 221 aa  50.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  34.67 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.8 
 
 		 244 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.8 
 
 		 244 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  32.95 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  33.77 
 
 		 170 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  33.77 
 
 		 170 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.4 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  36.26 
 
 		 202 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  35.37 
 
 		 242 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.53 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  21.25 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  30.34 
 
 		 210 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  32.79 
 
 		 202 aa  48.9  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  37.66 
 
 		 363 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35.53 
 
 		 218 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  31.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  31.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  32.22 
 
 		 255 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.87 
 
 		 249 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  34.18 
 
 		 352 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  31.17 
 
 		 368 aa  47.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  36.84 
 
 		 223 aa  47  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  33.72 
 
 		 319 aa  47  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  26.14 
 
 		 349 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  31.4 
 
 		 859 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  30 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  32.5 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  42.31 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  26.83 
 
 		 234 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  28.44 
 
 		 230 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  29.55 
 
 		 219 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  32.43 
 
 		 325 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  35.14 
 
 		 160 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  32.58 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.97 
 
 		 275 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.36 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  35.37 
 
 		 209 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  32.14 
 
 		 865 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  39.76 
 
 		 271 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  32.26 
 
 		 253 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  26.19 
 
 		 150 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  29.76 
 
 		 342 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  29.47 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  30.95 
 
 		 138 aa  44.3  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  36.36 
 
 		 354 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.98 
 
 		 210 aa  43.5  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  29.29 
 
 		 218 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>