72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5449 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0306  TonB, C-terminal  29.74 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5237  tonB domain protein  38.1 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  31.53 
 
 		 112 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.73 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.71 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  32.71 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  37.5 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  37.97 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  41.54 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  41.54 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.37 
 
 		 270 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  33.62 
 
 		 403 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.71 
 
 		 305 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  35.53 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  31.25 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  29.49 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  35.37 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  36.76 
 
 		 700 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  33.33 
 
 		 368 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  35.44 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  37.97 
 
 		 131 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  26.87 
 
 		 138 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  35.9 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  32.73 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  29.41 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  33.33 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.94 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.33 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.53 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  35.44 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.94 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  33.33 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  38.24 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  29.76 
 
 		 413 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  29.29 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  34.18 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  38.1 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  38.46 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  32.91 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.38 
 
 		 405 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  38.6 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  37.29 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  36.84 
 
 		 417 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  38.71 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  27.37 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4405  TonB-like protein  34.88 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  32.91 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  32.91 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  37.5 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  24.14 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  32.91 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  32.91 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  29.41 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  35.09 
 
 		 443 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  29.41 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  39.06 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  28.24 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  29.41 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  29.41 
 
 		 239 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  29.41 
 
 		 239 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 		 361 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  35.29 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  29.41 
 
 		 239 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  30.38 
 
 		 243 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  32.89 
 
 		 258 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  26.21 
 
 		 137 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  33.73 
 
 		 280 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  28.72 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  28.72 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>