127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02801 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  100 
 
 		 340 aa  669    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  66.32 
 
 		 334 aa  339  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  45.64 
 
 		 371 aa  298  7e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  45.13 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  50.75 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  44.44 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  42.86 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  44.44 
 
 		 203 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  44.44 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  42.86 
 
 		 203 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  42.86 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  30.12 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  40.62 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  37.66 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  44.44 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.04 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  36.51 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  34.48 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  41.27 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  42.86 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  41.38 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  38.1 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  39.68 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  43.42 
 
 		 110 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.71 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  43.86 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  43.86 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.1 
 
 		 217 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  39.68 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  39.68 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  39.68 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  39.68 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  39.68 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  36.14 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  39.68 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  38.1 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  36.51 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  38.1 
 
 		 207 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  38.1 
 
 		 206 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  37.04 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  37.04 
 
 		 252 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  37.04 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  36.51 
 
 		 207 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  36.51 
 
 		 207 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  33.73 
 
 		 249 aa  52.8  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  36.51 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.92 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  39.29 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  36.51 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  36.51 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  34.18 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  42.11 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  34.92 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  34.92 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  39.68 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  41.07 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  33.33 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  43.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30.38 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  39.44 
 
 		 148 aa  49.3  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  38.71 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  34.18 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  43.86 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  31.52 
 
 		 150 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  42.11 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.18 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  31.75 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  36.92 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  36.51 
 
 		 112 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  31.03 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  40 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  38.1 
 
 		 202 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  34.43 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  30 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  38.1 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  42.03 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  34.25 
 
 		 148 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  29.17 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.89 
 
 		 212 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  24.75 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  34.92 
 
 		 121 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  33.33 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  33.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  33.33 
 
 		 244 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  30.38 
 
 		 108 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  30.38 
 
 		 108 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  26.32 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  33.33 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  33.33 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0038  TonB-like protein  30.43 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11790  TonB family protein  27.03 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  32.26 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  29.47 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>